Beliau telah berpraktek di Mount Elizabeth Medical Center sejak tahun 1991 di
GYNAE CONSULTANCY PTE LTD (Bedah untuk Wanita). Walaupun praktek utamanya adalah di bidang ginekologi, kemandulan dan bedah endoskopik (juga disebut bedah lubang kunci atau bedah invasif minimal), beliau juga mempertahankan minat aktif dalam praktek institusi dan akademik.

Selama waktu ini, beliau terus mengajar di rumah sakit yang dulu disebut Kandang Kerbau Hospital. Dr. Yap Lip Kee memulai dan mengepalai Unit Bedah Invasif Minimal di K.K. Women’s Hospital yang baru dari tahun 1997 sampai 2003.

Beliau adalah Ketua Perhimpunan Endoskopi Ginekologi Internasional dari tahun 2001 sampai 2003. Beliau adalah anggota Dewan Medis Singapura, pada masa jabatan keduanya sejak tahun 1999.

Pada tahun 2002, beliau diangkat sebagai Direktur Medis dari Mount Elizabeth Fertility Centre (Pusat Fertilitas Mount Elizabeth).

Sebagai seorang dokter, beliau pertama-tama percaya pada “di atas segalanya, tidak membahayakan”, dan bahwa evaluasi risiko adalah sangat penting untuk keberhasilan.

Dr. Yap juga merupakan Profesor Ginekologi tamu di Xin Hua Hospital di Shanghai.

Beliau suka main ski dan golf, dan telah menikah dan mempunyai tiga orang anak.